بهمن جعفری، صبح ۲۶ آبان ۱۳۹۸، سومین روز از اعتراضات مردمی به افزایش قیمت بنزین، از خانه خارج شد تا به محل کار خود برود. در ساعت ۱۱:۳۰ صبح، در یک تماس تلفنی، به خانوادهٔ او خبر میدهند که او در نزدیکیهای چهارراه زندان تصادف کرده و به درمانگاه منتقل شدهاست. خانواده بلافاصله خود را به درمانگاه میرسانند و با وضعیت وخیم فرزندشان، به دلیل اصابت گلوله به وی، مواجه میشوند. نیروهای امنیتی چهار مرتبه به او شلیک کرده و سمت چپ بدن وی، در ناحیهٔ قلب، سینه و شکم را مورد هدف قرار داده بودند.
با توجه به کمبود امکانات درمانگاه، بهمن را جهت انتقال به بیمارستان مرکزی شیراز، به آمبولانس سوار میکنند اما او پیش از رسیدن به بیمارستان جان خود را از دست میدهد. پیکر بهمن به پزشکی قانونی سپرده شد. پس از آن، خانوادهٔ جعفری به پزشکی قانونی مراجعه کردند اما آنها پیکر را تحویل ندادند. خانواده، اجازهٔ دیدن پیکر فرزندشان را نیز نیافتند. پیکر بهمن جعفری، پس از پنج روز، در ۱ آذر ۱۳۹۸، به خانواده تحویل داده شد. مقامات امنیتی اجازهٔ خاکسپاری در دارالرحمهٔ شیراز را ندادند. تلاش سهروزهٔ خانواده نیز برای راضی کردنِ مقامات امنیتی شیراز در این مورد بینتیجه ماند.
پیکر بهمن جعفری، ۴ آذر ۱۳۹۸ در گورستان شهرک کُشن، واقع در ۴۰ کیلومتری شیراز، به خاک سپرده شد.